Uruguay regnes som et av de mest økologisk mangfoldige landene, med et bredt utvalg av stedegen flora og fauna. Det regnes som et av de grønneste og mest naturlige landene i regionen, med en liten befolkning, få byområder og eksepsjonelle naturlandskap. Dette gjør Uruguay til et paradis for fuglekikkere og alle som setter pris på naturen. Uruguays mangfoldige flora og fauna deles også med andre regionale land som Argentina og Brasil.
Floraen i Uruguay består av innfødte busker, trær og blomster som har bebodd dette landet i millioner av år. Noen trær har blitt utryddet eller finnes i florareservater, spesielt i departementene Salto og Rivera. Noen av de mest innfødte trærne er ceibo, hvis blomst regnes som Uruguays nasjonale og symbolske blomst . Vi kan også finne andre treslag som ombú, lind, jacaranda, espinillo og mbucuruyá. Treverket er høyt verdsatt til å lage møbler og også som brensel siden teksturen og konsistensen er veldig hard og sterk.
På fauna i Uruguay Vi kan si at den har noen likheter med den afrikanske faunaen, noen arter er veldig lik autoktone arter som bor i Afrika, et eksempel på dem er ñandú, som har et langt forhold til den afrikanske struts og med den australske emuen, kan vi finner også noen pattedyr i faunaen av Uruguay som capincho, og andre typer dyr som hjort, alligatorer, øgler, villsvin, rev, armadillos, aguara guazú, etc.
Når det gjelder fugler, har Uruguay en rekke små eksotiske og små fugler med lite farge, sammenlignet med det store utvalget av fugler som Brasil har, spesielt i sin tropiske sone. Noen typiske fugler i Uruguay er kanarifuglen, påfuglen, kardinalen, spurvene, churrinches, etc.